Genomica
A genômica é o estudo do genoma de um organismo, que é o conjunto completo de DNA presente em suas células. A genômica tem o potencial de transformar a forma como entendemos a biologia, permitindo-nos desvendar as complexidades dos organismos e suas interações com o ambiente. Através da genômica, podemos investigar as funções dos genes, entender as bases moleculares das doenças, e desenvolver novas terapias e tecnologias.
Com o rápido avanço da tecnologia de sequenciamento de DNA, a genômica tornou-se uma área de estudo cada vez mais acessível e importante. A análise genômica de grandes conjuntos de dados tem o potencial de revelar informações valiosas sobre a evolução, a diversidade e a função dos organismos. Além disso, a genômica está sendo usada para personalizar o tratamento de doenças, permitindo que médicos e pesquisadores adaptem os tratamentos com base na genética individual de um paciente. A genômica é uma área de pesquisa empolgante e em constante evolução, com o potencial de transformar a maneira como pensamos sobre a biologia e a medicina.
Textos
2. Inspecionando variantes com o IGV (Integrative Genomics Viewer)
3. Identificação de RNA não condantes (Long non coding RNAs ou long ncRNAs ou lncRNA) (RNAsamba)
4. Agrupamento de sequências (nucl ou prot) por similaridade (CD HIT)
5. Calculo de frequencia de códons de uma sequência no formato fasta com CodonW
6. Alinhamento com MAFFT e visualização com AliView
7. Montagem de reads longos com CANU (PacBio e Nanopore)
8. Montagem de genomas com SPAdes
10. Anotação de Ortologia Kegg (Kegg Orthology(KO)) com KofamKoala